Der CVJM Flacht wird geleitet von den beiden Vorsitzenden und einem Team aus gewählten und berufenen Menschen, die die Mitglieder vertreten und sich um die verschiedenen Aufgaben im Verein kümmern.
Das Leitungsteam hat sich in Fachbereiche aufgeteilt, deren Zuständigkeit dem Schaubild entnommen werden können: